“全能神”组织架构似金字塔,最顶端是“女基督”,下设监察组、牧区、区、小区、教会、小组6个等级。在这个等级分明、组织严密的邪教组织中,名义上最高权威“女基督”的主要工作只是负责说话。保护“女基督”的“七灵”会随时记下她的“著作”。知情者称:“女基督”只是傀儡,而“大祭司”赵维山才是真正的掌权者。
2000年,赵维山潜逃境外,在美国建立“全能神”总部,并通过互联网控制着中国大陆的教徒。同时任命核心成员罗某负责境内工作,依次设立与省级、地市级、县级、乡镇级相对应的下属分部,指定专门负责人。
“全能神”每一地区均设有专职财务人员,将敛聚、骗取来的金钱通过转账汇款或直接提交等方式交给邪教高层,然后被使用、挥霍和转移至境外。”